Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL20A1Q9P218 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms