Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFAF4Q9P032 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFAF4Q9P032 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms