Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VNN3Q9NY84 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms