Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALKBH4Q9NXW9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms