Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH2

TMEM242, Transmembrane protein 242, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM242Q9NWH2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM242Q9NWH2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM242Q9NWH2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms