Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms