Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZDHHC18Q9NUE0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms