Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms