Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms