Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNNM1Q9NRU3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms