Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms