Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms