Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms