Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31BQ9NQW1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms