Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4Q9NQC3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms