Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FANCFQ9NPI8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms