Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUFT1Q9NNX1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms