Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX8Q9HC52 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms