Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3GQ9HC16 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms