Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGR6Q9HBX8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGR6Q9HBX8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms