Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELL3Q9HB65 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms