Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms