Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER1Q9C0I3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER1Q9C0I3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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