Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4CQ9C0C4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms