Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms