Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms