Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms