Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms