Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC106Q9BWC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC106Q9BWC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms