Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms