Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSG1Q9BU20 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms