Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3CQ99985 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms