Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX2Q99697 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms