Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS3Q99687 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms