Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD1Q99460 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms