Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAP1L3Q99457 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms