Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms