Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSPAN18Q96SJ8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms