Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGS1Q96RS0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGS1Q96RS0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms