Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM227BQ96M60 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227BQ96M60 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms