Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms