Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUCLG2Q96I99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms