Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms