Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms