Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms