Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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