Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS3Q969F9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms