Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC4Q92889 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC4Q92889 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms