Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRAT1Q92837 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms