Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOPBP1Q92547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOPBP1Q92547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms